油污、泥沙、渔网都能成为海底珊瑚群死亡杀手之一，但基隆市外木山渔港底却意外发现有大面积珊瑚群生长，除了轴孔珊瑚、雀屏珊瑚，更有与「绿岛大香菇」同种类团块微孔珊瑚，也代表渔港底环境越变越乾淨，更适合对环境「敏感」的珊瑚群生存，对此基隆市政府渔业行政科也积极向船家推广使用垃圾收集袋，避免船隻海抛垃圾造成污染。 针对渔港内部环境维护整理，产发处渔业行政科长何惠玫表示，市府定期派人清洁渔港整体环境，除了清除、打捞垃圾工作外，也定期在港口区域浚深、清淤泥，并在各渔港摆放废弃机械用油回收桶，避免不肖渔民偷倒油污入海，造成重油污染。 另外，去年底也首次在正滨渔港对船家发放垃圾收集袋，避免渔船将垃圾海抛造成二度污染。近年来渔民对海洋生态保育意识抬头，不少人自主性驾小艇在渔港打捞废弃物，或是顺手将渔港外海漂垃圾带回丢弃。 至于如何在渔港开发及珊瑚生态维护两者间取得两全，何惠玫说，目前海面下的珊瑚群还尚未直接影响渔船进出港口，先排除渔船的安全问题，因此市府採取维护措施，尽量避免该区域浚深工程。 廖运志说，珊瑚较易生长在乾淨水质、温暖气候，算是环境变得更洁淨的指标之一，因此在外木山渔港底发现珊瑚群是十分难得，但对于要如何达到人为开发及生态保留两者平衡，作为一个渔业用途的渔港，能做就是尽量维持水域整洁及不要太过干预海底珊瑚。
